TSK凝胶色谱柱的性能除了与固定相性能有关外，还与填充技术有关。在正常条件下，填料粒度>20um时，干法填充制备柱较为合适；颗粒<20um时，湿法填充较为理想。填充方法一般有4种：①高压匀浆法，多用于分析柱和小规模制备柱的填充；②径向加压法；③轴向加压法，主要用于装填大直径柱；④干法。柱填充的技术性很强，大多数实验室使用已填充好的商品柱。
TSK凝胶色谱柱的获得，装填技术是重要环节，但根本问题还在于填料本身性能的优劣，以及配套的色谱仪系统的的结构是否合理。
无论是自己装填的还是购买的色谱柱，使用前都要对其性能进行考察，使用期间或放置一段时间后也要重新检查。柱性能指标包括在一定实验条件下（样品、流动相、流速、温度）下的柱压、理论塔板高度和塔板数、对称因子、容量因子和选择性因子的重复性，或分离度。一般说来容量因子和选择性因子的重复性在±5%或±10%以内。进行柱效比较时，还要注意柱外效应是否有变化。
一份合格的色谱柱评价报告应给出柱的基本参数，如柱长、内径、填料的种类、粒度、色谱柱的柱效、不对称度和柱压降等。
在实际分析过程中，液相色谱仪流动相与色谱柱的温度，影响着组分的分离平衡，TSK凝胶色谱柱对于使用色谱柱温箱的有益之处有以下几点：
1.可以使保留时间相对恒定，对需要进行的定性鉴别可提高其可信度；
2.保留时间的重复性是色谱分析进行定量的基础，这一点在液相色谱仪检定规程中有严格的要求。不同的保留时间不仅不能判断其成份的一致性，同时，由于保留时间不同峰面积也必将发生变化，其检测结果的可信度将受质疑。
3.温差较大时，因保留时间不稳将增加检测工作的复杂性。
4.温度低的时候，因流动相黏度增加而使检测时间延长，同时增加泵的磨损，影响设备的使用寿命。
5.如果温度过低也可能出现堵塞高压恒流泵、管路、进样阀、色谱柱的现象。其原因就是温度低溶解度相对下降而出现缓冲盐结晶。
6.温度低时还因溶解度下降使杂质吸附在填料上而难于洗脱，从而影响色谱柱的使用寿命。
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